BOINC - POEM@HOME

Marty McFly · úte říj 23, 2007 7:32 am

http://boinc.fzk.de/poem/

Další projekt zaměřený na proteiny, kterým nerozumím

a proto se neodvážím psát bližší informace.

Příspěvek od **Honza** » stř říj 24, 2007 6:54 pm

Mozna si to blbe pamatuji, ale nekde (asi na jejich strankach) jsem cetl, ze se snazi vzit to "lepsi" z ruznych pristupu (Rosetta, Folding) a nejak to spojit.
EDIT: ha - tady

LiborA · Příspěvek od **LiborA** » pát pro 07, 2007 10:32 am

Docela zajímavé čtení o metodách používaných k výpočtům proteinů je na jejich stránkách zde

vyzkumnik · Příspěvek od **vyzkumnik** » pát pro 07, 2007 2:34 pm

pocita to tu nekdo stoji to za to? nebo radsi zustat u rosseta home?

LiborA · Příspěvek od **LiborA** » pát pro 07, 2007 5:34 pm

vyzkumnik píše:pocita to tu nekdo stoji to za to? nebo radsi zustat u rosseta home?

Na tuhle otázku se nesnadno odpovídá. Projekt používá vědecký přístup založený na termodynamické hypotéze C. B. Anfinsena nositele Nobelovy ceny za chemii v roce 1972. Jestli se ale vyplatí či nevyplatí zůstat u Rossety záleží na Tvých preferencích. Pro mne je třeba Rosseta prakticky nepoužitelná z důvodů obrovských požadavků na velikost paměti RAM.

vyzkumnik · Příspěvek od **vyzkumnik** » pát pro 07, 2007 7:27 pm

me akorat u tohoto projektu stve ze jsou prilis kratke jednotky 2 minuty je pocitam a na q6600@3000MHz 3gb ram a nema to grafickej vystup neni na co koukat(ale to zase tak podstatneneni

)

Fran · Příspěvek od **Fran** » pát pro 07, 2007 8:26 pm

vyzkumnik píše:me akorat u tohoto projektu stve ze jsou prilis kratke jednotky 2 minuty je pocitam a na q6600@3000MHz 3gb ram a nema to grafickej vystup neni na co koukat(ale to zase tak podstatneneni )

2 minuty? To máš asi "kliku" na takové krátké jednotky. Mně chodí jednotky s dobou výpočtu 0,5 - 2,5 hodiny.

Co mě štve, je že občas když se projekt normálně přeruší, počítá jiný a pak se vrátí výpočet zpátky na Poem, tak jede znova od nuly.

vyzkumnik · Příspěvek od **vyzkumnik** » pát pro 07, 2007 8:33 pm

7.12.2007 19:30:56|Poem@Home|Message from server: (reached per-host limit of 20 tasks, 5 tasks per cpu) a todle stve me co to je za projekt? s tak nizkym pridelem jednotek? mno asi nic pro me

Příspěvek od **Honza** » pát pro 07, 2007 9:22 pm

Delka vypoctu opravdu lita od 3 minut po 2+ hodiny.

@ Fran - kdyz to nema checkpointy, tak musis mit zapnuto leave in memory.
@ vyzkumnik - nevim, co mas za problem. Me pise Maximum daily WU quota per CPU - 500/day. No asi zkusim, jestli nebude za chvilku taky na suchu...

vyzkumnik · Příspěvek od **vyzkumnik** » pát pro 07, 2007 9:29 pm

sice me to pise limit ale dava to jednotky porad

a stim creditem nic moc rosseta dava vic

Fran · Příspěvek od **Fran** » pát pro 07, 2007 9:43 pm

Honza píše:Delka vypoctu opravdu lita od 3 minut pro 1+ hodinu.

@ Fran - kdyz to nema checkpointy, tak musis mit zapnuto leave in memory.
@ vyzkumnik - nevim, co mas za problem. Me pise Maximum daily WU quota per CPU - 500/day. No asi zkusim, jestli nebude za chvilku taky na suchu...

Mám zapnuté leave in memory, se 2GB RAM si to můžu dovolit

Ale to je celkem fuk, reagoval jsem spíš na tu délku výpočtu.

LiborA · Příspěvek od **LiborA** » sob pro 08, 2007 9:30 am

Hm, tak bez check pointů to není projekt pro můj domácí počítač. Škoda

EDIT: tak checpointy by měly pracovat v aplikaci 0.07 tak uvidím

LiborA · Příspěvek od **LiborA** » pon pro 24, 2007 7:23 am

Poem zveřejnil první výsledky.