Otázka smìøuje i do dalších "Life science" projektù, ale vybral jsem si tento.
Sleduje nìkdo, co se v Rosettì a Predictoru pocitá? Pøípadnì ze známých projektù také UD, Grid, WorldCommunityGrid, D2OL/TSC èi podobné?
Nejde mi ted o verohodnost, ale proste o to, na jakých protejnech se pracuje atp.
Jednak z hlediska pøekryvu výpoètù (vím, že jsou rùzné zpùsoby pøístupu a metod simulací), druhak - a to zejména - v souvislosti s aktuálním nebezpeèím.
Døíve byl "polulární" SARS a Ebola, dnes je to Ptaèí chøibka...
Co se poèítá?
Moderátoři: zdespi, Moderátoři
-
Duro Kotulic Bunta
- Banánová odměna
- Příspěvky: 702
- Registrován: sob úno 26, 2005 4:25 pm
- Bydliště: Stupava, SK
- Kontaktovat uživatele:
Pokial viem, tak predictor uvadza aj konkretne sekvencie, ktore prave pocita. Ale vystup z tychto vypoctov nie je hned vedecky pouzitelny, pretoze institut, ktory tento projekt vedie, pomocou tychto vypoctov len testuje a vyvija novy software na predpovedanie struktury proteinov z ich sekvencie (to asi vsetci viete, je to dolezite pre simulacie finkcii proteinov, opravu DNA molekuly, vyvoj novych liekov napr. proti rakovine a genetickym chorobam atd). Ucelom je teda na zaklade tychto vypoctov vyvinut novy velmi prinosny software.
Tento software sa bude potom s najvacsou pravdepodobnostou komercne predavat. My sme predchadzajuce softwary presne od tohto institutu kupili za plne komercnu cenu dvadsat tisic US dolarov. Institut je neziskovy, to znamena nie je to tvrda komercia, ale soft ktory sa pomocou vasho darovaneho CPU vyvinie sa predava za komercnu cenu.
Mne toto na tom projekte dost vadi, ked sme od nich kupili soft za 20 k$ tak sa mi nechce venovat im este aj svoj CPU na to, aby vyvinuli nieco, co od nich zas potom kupime za takze prachy. Samozrejme, ten soft bude v konecnom dosledku sluzit vede, ale radsej venujem svoj cas napr. Einsteinovi, ktory je vladny a teda zavisly na statnych dotaciach, a teda moj CPU sa mu zide viac.
O ostatnych life science projektoch vela neviem, mali by sa podla mna vzajomne lepsie definovat, lebo ich je vela a bezny uzivatel si moze povedat, ze "ale sakra ved ich je kopa rovnakych, maju v tom nejaky bordel, idem radsej ratat to, o com aspon trocha viem o com je...".
Problem je v tom, ze tieto ostatne projekty rataju kazdu chvilu nieco ine, mam na mysli iny konkrenty vedecky problem, kedze problematika life science je ohromne siroka a zlozena z mnohych malych problemikov, na rozdiel od modernej kozmologie/casticcovej fyziky, kde existuju velke projekty (LHC, gravitacne vlny...). Nemam cas a bohuzial ani chut neustale sledovat drobnosti co momentalne rataju, okrem toho nemaju to nijako zvlast prehladne spracovane...
Tot moja skusenost, info a postoj k tymto veciam.
Tento software sa bude potom s najvacsou pravdepodobnostou komercne predavat. My sme predchadzajuce softwary presne od tohto institutu kupili za plne komercnu cenu dvadsat tisic US dolarov. Institut je neziskovy, to znamena nie je to tvrda komercia, ale soft ktory sa pomocou vasho darovaneho CPU vyvinie sa predava za komercnu cenu.
Mne toto na tom projekte dost vadi, ked sme od nich kupili soft za 20 k$ tak sa mi nechce venovat im este aj svoj CPU na to, aby vyvinuli nieco, co od nich zas potom kupime za takze prachy. Samozrejme, ten soft bude v konecnom dosledku sluzit vede, ale radsej venujem svoj cas napr. Einsteinovi, ktory je vladny a teda zavisly na statnych dotaciach, a teda moj CPU sa mu zide viac.
O ostatnych life science projektoch vela neviem, mali by sa podla mna vzajomne lepsie definovat, lebo ich je vela a bezny uzivatel si moze povedat, ze "ale sakra ved ich je kopa rovnakych, maju v tom nejaky bordel, idem radsej ratat to, o com aspon trocha viem o com je...".
Problem je v tom, ze tieto ostatne projekty rataju kazdu chvilu nieco ine, mam na mysli iny konkrenty vedecky problem, kedze problematika life science je ohromne siroka a zlozena z mnohych malych problemikov, na rozdiel od modernej kozmologie/casticcovej fyziky, kde existuju velke projekty (LHC, gravitacne vlny...). Nemam cas a bohuzial ani chut neustale sledovat drobnosti co momentalne rataju, okrem toho nemaju to nijako zvlast prehladne spracovane...
Tot moja skusenost, info a postoj k tymto veciam.
Podpis
Is it by logic that we prove, but by intuition that we discover. [J. H. Poincaré, mathematician (1854-1912)]
Is it by logic that we prove, but by intuition that we discover. [J. H. Poincaré, mathematician (1854-1912)]
@ Duro - diky za komentar k vyvoji SW. Neni to to, na co jsem se ptal, ale i tak je to zajimave.
Jeste upresnim svuj dotaz - drive (kdyz jsem to sledoval) life science projekty zarazovali vypocetni ulohy podle realne hrozby v polulaci (lze cist prilezitosti na trhu). At jiz to byl SARS, Ebola ci co zrovna bylo hrozbou (popularni). V soucasnosti se dost mluvi o ptaci chribce, ktere se blizi - a nejspis brzy dostane do zapadni Evropy. Jak jsem byl informovan, je pro ni pouze 1 lek, pusobici jak preventivne, tak lecebne pokud je podan do 48 hodin. A samosebou je dost drahy.
Ptaci chribka ma jiz zajimavou umrtnost a stoji za to se na ni lepe podivat. Nejde o to jestli je to umele vyslechteny vir napriklad Spanelske chribky. Proste mi slo o to, jestli kdyz tento vir dostal takovou medialni poroznost, jestli mu i life science projekty davaji patricnou prioritu.
Nebo alespon obecne - na co se life science projekty zameruji soucasne - tedy krome vyvoj SW, ktery jde v teto oblasti dost dopredu.
EDIT: Nebude trvat dlouho a rozjede se dalsi life science projekt pro BOINC - SIMAP.
Jeste upresnim svuj dotaz - drive (kdyz jsem to sledoval) life science projekty zarazovali vypocetni ulohy podle realne hrozby v polulaci (lze cist prilezitosti na trhu). At jiz to byl SARS, Ebola ci co zrovna bylo hrozbou (popularni). V soucasnosti se dost mluvi o ptaci chribce, ktere se blizi - a nejspis brzy dostane do zapadni Evropy. Jak jsem byl informovan, je pro ni pouze 1 lek, pusobici jak preventivne, tak lecebne pokud je podan do 48 hodin. A samosebou je dost drahy.
Ptaci chribka ma jiz zajimavou umrtnost a stoji za to se na ni lepe podivat. Nejde o to jestli je to umele vyslechteny vir napriklad Spanelske chribky. Proste mi slo o to, jestli kdyz tento vir dostal takovou medialni poroznost, jestli mu i life science projekty davaji patricnou prioritu.
Nebo alespon obecne - na co se life science projekty zameruji soucasne - tedy krome vyvoj SW, ktery jde v teto oblasti dost dopredu.
EDIT: Nebude trvat dlouho a rozjede se dalsi life science projekt pro BOINC - SIMAP.
-
Necroman
- Expert
- Příspěvky: 496
- Registrován: pon led 17, 2005 2:43 pm
- Bydliště: Louny
- Kontaktovat uživatele:
Re:
Mohu jen doplnit, ze jedinym specialnim lekem na Ptaci chripku - avian flu, nebo take virus H5N1 je zatim Tamiflu . Problem je ale ten, ze nedavno byly ve Vietnamu zaznamenany pripady, kdy byla jiz jista mutace viru odolna i proti tomuto pripravkuHonza píše:Jak jsem byl informovan, je pro ni pouze 1 lek, pusobici jak preventivne, tak lecebne pokud je podan do 48 hodin. A samosebou je dost drahy.
. Take se mluvi o tom, ze dobre vysledky v lecbe chripky, nejen ptaci, ma i lek Relenza, aby byl ale pouzitelny ve vetsi mire, bylo by zapotrebi vytovrit jeho specialni formu urcenou primo na lecbu H5N1... aneb, doufejme, ze se to podari, jinak jsme v pytli 
.
Přednáška
Sice je to pul roku stary, ale treba by to nekoho zajimalo:
http://norfolk.cs.washington.edu/htbin- ... cgi?id=449
Zaznam prednasky "Computing structural biology". Ma to hodinu, je lepsi si stahnout tu High-Bandwidth verzi (>400MB), jinak nejsou texty moc citelny. Mensi verze ma 124MB. Je to vpodstate o rosete a jak to funguje...
http://norfolk.cs.washington.edu/htbin- ... cgi?id=449
Zaznam prednasky "Computing structural biology". Ma to hodinu, je lepsi si stahnout tu High-Bandwidth verzi (>400MB), jinak nejsou texty moc citelny. Mensi verze ma 124MB. Je to vpodstate o rosete a jak to funguje...