BOINC - Hydrogen@Home

[Duha]

Po přihlášení do projektu a stahování prvních WU: počáteční download cca 63MB

[Xenostellar]

Tak už jsem zpočítal tři jednotky. Další dvě hodily chybu

Kód: Vybrat vše

23.1.2008 15:23:46|Hydrogen@Home|Reason: Unrecoverable error for result nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6 ( - exit code -1 (0xffffffff))
23.1.2008 15:23:52|Hydrogen@Home|[error] Can't rename output file nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6_0
23.1.2008 15:23:52|Hydrogen@Home|Computation for task nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6 finished

Je to normální?

[LiborA]

Tak už jsem zpočítal tři jednotky. Další dvě hodily chybu

Kód: Vybrat vše

23.1.2008 15:23:46|Hydrogen@Home|Reason: Unrecoverable error for result nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6 ( - exit code -1 (0xffffffff))
23.1.2008 15:23:52|Hydrogen@Home|[error] Can't rename output file nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6_0
23.1.2008 15:23:52|Hydrogen@Home|Computation for task nsc1.mol2_pdb1s3i.pdb_1201075937_6 finished

Je to normální?

Naprosto na jednom stroji jsem z posledních 24 jednotek úspěšně dokončil jen 3 - prostě klasický alfa projekt

[LiborA]

Pokud se někdo blíže zabývá o výpočty kvantové mechaniky/molekulární mechaniky (QM/MM), tak zde je takový souhrnný článek.

[LiborA]

Jack hledá pomoc okolo optimalizace Pythonu. Bližší ve fóru projektu.

[LiborA]

Jack momentálně zkouší různé nové nastavení aplikace (ve velmi krátké době byla k dispozici aplikace 7.41, 7.51, 7.61 a naní je platná 7.71). Bohužel jsou stále nějaké problémy, takže je možné, že nové aplikace budou rychle následovat.

[Fran]

Jack momentálně zkouší různé nové nastavení aplikace (ve velmi krátké době byla k dispozici aplikace 7.41, 7.51, 7.61 a naní je platná 7.71). Bohužel jsou stále nějaké problémy, takže je možné, že nové aplikace budou rychle následovat.

Koukám na to jako blázen, furt to stahuje desítky MB dat..
Navíc mi to dělá šílený věci, ani jedna z těch aplikací mi nejede. Jsou sice vidět mezi procesy, ale neběží, alespoň vytížení procesoru je na 0. Musel jsem to ručně zrušit. Zatím jsem pozastavil stahování dalších jednotek než se to ustálí.

Normálně jely jen cp2k 1.0 a autodock 7.31, ovšem u druhé zmiňované je dost výsledků s chybou.

[LiborA]

Normálně jely jen cp2k 1.0 a autodock 7.31, ovšem u druhé zmiňované je dost výsledků s chybou.

U druhé jmenované je spíš zázrak, když nějaká neskončí chybou. Na jednom kompu jsem už projekt úplně zastavil a na druhém jsem dal teď přes víkend pozastavit, protože Kerio mi stejně nepustí novou aplikaci bez ručního potvrzení "neškodnosti".

[LiborA]

Snad bude toho stahování již méně. Jack se učí používat archivátor, zatím jak se zdá mu to moc nejde, neboť se mu nepodařilo rozchodit bzip a přešel na 7zip se kterým mu to funguje - takže se kromě jednotky a aplikace stahuje i 7z archivátor
Jinak již je aplikace Autodock 7.81 a CP2K 4.0. Zatímco před víkendem mi beznadějně padala aplikace Autodock a CP2K byla bezchybná, tak momentálně se zdá, že po přechodu na nové aplikace je to přesně naopak , ale aspoň Autodock výrazně zrychlil z cca 20 minut na nějakých 2,5 (i když zatím jsem chytil jen jednu jednotku Autodock)

[Honza]

7zip je dobry a taha se pouze jednou. Nakonec mozna usetri, protoze bude asi ucinejsi nez bzip. Pakovat je urcite krok spravnym smerem, i kdyz bzipem by to bylo "cistci".
Tak vyrazne zrychleni aplikace? No jeste hodit 64-bit verzim 7zip a bude to super.
(vcera mi jedna varka take hned padla).

[LiborA]

Momentálně byla úplně stažena aplikace CP2K, asi dělala vážně moc chyb

[LiborA]

Byla vypuštěna nová aplikace Autodic pro Win 7.91 - Lin 7.92 - Mac 7.93 . Už pár dní máme i aplikaci CP2K 6.0.

Bohužel mi CP2K naprosto nefunguje 100% chyb (předchozí verze 2.0 byla naopak bezchybná)

[LiborA]

Tak Jack stáhl aplikaci CP2K do doby než zjistí jak zakomponovat model využívající metodu Nudge Elastic Band, která je v Amberu.

Jinak aplikace pro Windows dospěla do verze 8.01 a u mne zatím je chybovost cca 1/3 což je výrazný posun k lepšímu

Projekt má také svoje městečko na Myminicity.

[Fran]

Tak Jack stáhl aplikaci CP2K do doby než zjistí jak zakomponovat model využívající metodu Nudge Elastic Band, která je v Amberu.

Jinak aplikace pro Windows dospěla do verze 8.01 a u mne zatím je chybovost cca 1/3 což je výrazný posun k lepšímu

Projekt má také svoje městečko na Myminicity.

Po tvém předchozím příspěvku jsem dal Hydrogenu zase šanci. Odvděčil se mi stažením 85 MB (!) aplikací a tří jednotek, všechny skončily s chybou ihned po startu. Navíc mám problém s firewallem, protože se mě neustále ptá, jestli může spustit wrapper (zřejmě se také mění verze). Zajímavé je, že změny ostatních aplikací mu nevadí. Jelikož jsem humanoid a nesedím u PC 24 hodin denně, nemohu to dost dobře ovlivnit. Bohužel nemůžu nastavit, aby firewall určité složky ignoroval, jako to jde u antiviru.

[LiborA]

Hydrogen bude mít teď nějakou dobu výpadek z důvodů přechodu na nový server.